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基于微衛(wèi)星標記的雪豹種群結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性

媒體:網(wǎng)絡(luò)  作者:內(nèi)詳
專業(yè)號:官渡區(qū)自然資源局 2024/11/25 16:09:34

https://mp.weixin.qq.com/s/bDWdOpus_K8joeLbNfZncQ

作 者:周穎娜1, 李金霖1, 馬躍1,2,3, 王震1,2,3

單 位:

東北林業(yè)大學野生動物與自然保護地學院,哈爾濱, 150040

國家林業(yè)和草原局野生動植物檢測中心,哈爾濱, 150040

東北林業(yè)大學司法鑒定所,哈爾濱,150040

引文信息:

周穎娜,李金霖,馬躍,等.基于微衛(wèi)星標記的雪豹種群結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性[J].野生動物學報,2024,45(4):699-708.

DOI:10.12375/ysdwxb.20240402

摘  要

掌握雪豹(Panthera uncia)的遺傳多樣性信息對其保護和管理有重要意義。

對104只雪豹個體的組織樣品提取DNA,結(jié)合文獻中提供的70個雪豹基因分型數(shù)據(jù),利用9個微衛(wèi)星多態(tài)性位點進行遺傳多樣性研究。

圖片

M代表BGI D2000 Plus DNA Ladder;9 ~ 16代表8個樣本。

部分雪豹樣品的微衛(wèi)星引物PCR擴增結(jié)果

圖片

A為基于70個文獻提供的雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點的PCA結(jié)果;B為基于174個雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點的PCA結(jié)果;C為基于174個未判定地理位置的雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點的PCA結(jié)果。樣本來源:中部1 ~ 125(青海北部1 ~ 6,青海南部7 ~ 11,喜馬拉雅地區(qū)12 ~ 24,25 ~ 125四川、西藏、青海);西部126 ~ 141(印度126 ~ 129,巴基斯坦130 ~ 133,塔吉克斯坦134 ~ 137,吉爾吉斯斯坦138 ~ 141);北部142 ~174(蒙古國西部142 ~ 156,蒙古國南部:157 ~ 171,蒙古國樣本172 ~ 174),其中XB_B13、XB_x07、XB_b81為蒙古國進境執(zhí)法檢查收集樣品。

雪豹種群主成分分析

圖片

A為K = 3時,基于70個文獻提供的雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點種群結(jié)構(gòu)結(jié)果;B為K = 2時,基于174個雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點的種群結(jié)構(gòu)結(jié)果;C為K = 3時,基于174個雪豹基因分型數(shù)據(jù)及9個微衛(wèi)星位點的種群結(jié)構(gòu)結(jié)果;D為ΔK 評估值。

雪豹種群結(jié)構(gòu)分析結(jié)果

圖片

A為文獻[16]提供的70個樣本;B為整合的174個樣本。紅色、綠色和藍色分別為文獻[16]提供的中部、西部和北部個體;紫色、黃色分別為本研究收集的中部、北部個體。

基于70只或174只雪豹個體間的Nei’s遺傳距離構(gòu)建的NJ聚類樹

結(jié)果顯示:

當樣本量從70個增加到174個時,雪豹種群有分化為2個種群的趨勢,即西北部群和中部群;共檢測到45個等位基因(Na),中部、西北部2個種群平均每個位點Na分別為4.556和4.667,平均期望雜合度(He)分別為0.574和0.591,平均觀測雜合度(Ho)分別為0.517和0.498。

雪豹群體的平均近交系數(shù)(FIS)為0.137,平均遺傳分化系數(shù)(FST)為0.067,平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.602,種群間遺傳變異為15.24%,種群內(nèi)遺傳變異為84.76%。

9個微衛(wèi)星位點具有中高程度多態(tài)性,與其他雪豹研究相比,2個雪豹種群遺傳多樣性處于中等水平,種群間遺傳分化水平處于中等程度,遺傳變異大部分來源于群體內(nèi)部。

研究結(jié)果對全球雪豹的種群結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性研究具有重要意義,也為雪豹未來的科學保護提供可靠的遺傳背景。

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